Upload über das Meldeportal

Zielstellung

• Hochladen von Sequenzen und Metainformationen über das DEMIS-Meldeportal 
• Bereitstellung der Metadaten über CSV-Datei (Dokumente für den Upload im Meldeportal) 
• Sammel-Upload von bis zu zwei Sequenzdateien im Format FASTA oder FASTQ (auch als GZip komprimiert) pro Zeile
  • Maximalgröße pro Datei: 999 MB (Entpackte Größe bei gezippten Dateien ca. 6 GB)

Vorbedingungen

• Authentifizierung über geeignetes Verfahren im Meldeportal (Beispielsweise BundID) 
• Nutzer ist durch das RKI für IGS freigeschaltet worden (siehe Freischaltung für IGS (Meldeportal))

Ablauf

Schritt 1:

• Hochladen der vorbereiteten und korrekt befüllten CSV

Schritt 2:

• Auswählen der Sequenzdateien

• Hinweis: Der Übergang zum nächsten Schritt ist erst möglich, wenn alle Sequenzen bereitgestellt wurden. Dies ist durch die Icons vor dem Dateinamen ersichtlich.

Schritt 3:

• Eigentlicher Upload
• Die bereitgestellten Sequenzen werden nacheinander hochgeladen. Nachdem alle Sequenzen einer Zeile erfolgreich hochgeladen wurden, wird automatisiert aus den Metainformationen eine FHIR-Meldung erstellt und diese an DEMIS übermittelt.
• Der Prozess wird im Anschluss automatisiert mit der nächsten Zeile fortgesetzt. 
• Sollte bei einer Zeile ein Fehler auftreten, wird der Prozess ebenfalls automatisch fortgesetzt.

• Bitte schließen Sie das Fenster möglichst nicht.
• Der Uploadprozess kann je nach Dateigröße etwas mehr Zeit in Anspruch nehmen.
• Im Anschluss an den Upload wird die Sequenzdatei automatisiert validiert. Dies kann je nach Dateigröße ebenfalls etwas Zeit in Anspruch nehmen.
• Der Prozess ist sequenziell.

Schritt 4:

• Sobald alle Uploads abgeschlossen sind, kann die Ergebnisübersicht angezeigt werden.

• Hier ist pro Zeile der Gesamtstatus ersichtlich.
• Es kann hier die IGS-ID der Zeile eingesehen werden.

Schritt 5:

• Sobald alle Uploads abgeschlossen sind, kann die Ergebnisübersicht angezeigt werden. Diese kann als csv-Report heruntergeladen und gespeichert werden
• In der Spalte "Meldung übermittelt" können einzelne Statusangaben zu den Übermittlungen angezeigt werden.