Dokumente für den Upload im Meldeportal

Informationen für die Eintragung in die Vorlage

Die Angaben in der Vorlage für den Upload werden da wo vorgesehen über ein Dropdown-Menü gemacht. Die Datumsangaben erfolgen im Format YYYY-MM-DD. Angabe zum SPECIES_CODE und ISOLATION_SOURCE_CODE erfolgen als SNOMED-CT Code aus den erregerspezifischen DEMIS ValueSets (AnswerSets; MaterialSet). Genauer Angaben zu den Metadaten-Spezifikationen finden Sie hier in der Wissensdatenbank unter Metadaten für Upload via csv oder LIS-Schnittstelle. Rot markierte Header-Spalten sind Pflichtangaben. Orange markierte Angaben im Bereich REPOSITORY müssen vorliegen, wenn überhaupt Angaben dazu gemacht werden.

Zusatzinfo für den Upload:

• Es dürfen nur Sequenzdaten für humane Proben hochgeladen werden
• Bitte geben Sie vorerst keine Angaben zu AUTHOR der Sequenz oder UPLOAD_SUBMITTER an. Hier stehen noch Datenschutzrechtliche Klärungen aus
• Das DATE_OF_SUBMISSION wurde aus der Vorlage für den Upload via DEMIS entfernt. Dieses wird vom Backend automatisch gesetzt
• Ein Speichern und Wiederöffnen der csv Datei vor dem Upload hat häufig zur Folge, dass sich das Datumsformat oder sehr lange SNOMED-CT Codes verändern. Dann ist ein Upload nicht mehr fehlerfrei möglich.