FAQ für IGS

Technische Fehler, insbesondere HTTP Status Codes können folgende Ursachen haben:

• Temporäre technische Probleme im DEMIS Meldeportal, diese Fehler werden von uns behoben
• Probleme in der Netzwerk-Konnektivität, bitte prüfen Sie Ihre Netzwerk-Konfiguration

Grundsätzlich lassen sich die Fehler durch Korrektur der Felder in der CSV und erneuten Upload beheben. Bitte prüfen Sie, dass die CSV im korrekten Format übermittelt wurde und gemäß den Vorgaben befüllt wurde. Die angezeigten Fehlermeldungen geben Hinweise welche Stellen zu korrigieren sind.

Hinweise:

• Verwenden Sie möglichst nur die Original Excel Datei zum Ausfüllen der Metainformationen. Diese finden sie hier: Dokumente zum Download
• Öffnen Sie nach dem Export die CSV-Datei nicht mehr mit Excel, da dies die Formatierung oder Werte wie insbesondere Datumsangaben abändert.
• Für den Upload der CSV-Datei wird eine maximale Größe von 1 MB unterstützt.
• Anführungszeichen um Header-Felder sind nicht zulässig.

Wie kann ich meine Organisation für IGS (Integrierte Genomische Surveillance) per Schnittelle freischalten lassen?

Um über DEMIS an der Integrierten Genomischen Surveillance teilzunehmen, muss die Organisation/DEMIS-ID manuell berechtigt werden.

Bitte wenden Sie sich hierfür mit Ihrer DEMIS-ID an den Support: demis-support@rki.de

Wie kann ich meine Organisation für IGS (Integrierte Genomische Surveillance) per Portal freischalten lassen?

Um über DEMIS an der Integrierten Genomischen Surveillance teilzunehmen, muss die Organisation manuell berechtigt werden.  Bitte wenden Sie sich hierfür an den Support: demis-support@rki.de

Untenstehend sind weitere Informationen hierfür aufbereitet.

Technische Fehler, insbesondere HTTP Status Codes können folgende Ursachen haben:

• Temporäre technische Probleme im DEMIS Meldeportal, diese Fehler werden von uns behoben
• Probleme in der Netzwerk-Konnektivität, bitte prüfen Sie Ihre Netzwerk-Konfiguration

Im Rahmen des Sequenzdaten-Uploads wird je Zeile in der CSV eine Nachricht generiert und an DEMIS gesendet. Diese Nachricht muss konform zu einem spezifischen FHIR-Profil sein. Der Dialog, der die Validierungsfehler zur Anzeige bringt, ermöglicht auch das Kopieren des vollständigen Fehler-Reports in die Zwischenablage. Hier können weitere Hinweise über die Fehlerursache gefunden werden. Grundsätzlich lassen sich die Fehler durch Korrektur der Felder in der CSV und erneuten Upload der Sequenzdaten beheben. Für weitere Details finden Sie untenstehend weitere Informationen. 

Hinweise:

• Verwenden Sie möglichst nur die Original Excel Datei zum Ausfüllen der Metainformationen. Diese finden sie hier: Dokumente zum Download
• Benutzen Sie als Vorlage für die Befüllung der Exceltabelle die ValueSets, die im IGS-Profil hinterlegt sind: link einfügen
• Öffnen Sie nach dem Export die CSV Datei nicht mehr mit Excel, da dies die Formatierung oder Werte wie insbesondere Datumsangaben abändert.

Technische Fehler, insbesondere HTTP Status Codes können folgende Ursachen haben:

• Temporäre technische Probleme im DEMIS Meldeportal, diese Fehler werden von uns behoben
• Probleme in der Netzwerk-Konnektivität, bitte prüfen Sie Ihre Netzwerk-Konfiguration

Um beim Upload von Sequenzdaten eine gültige Validierung zu erzielen, ist insbesondere auf folgende Punkte zu achten:

• Korrektes Kompressionsformat: IGS unterstützt für Sequenzdaten die GZIP-Komprimierung.
• Hash der Sequenzdaten korrekt bestimmen: Es ist darauf zu achten, dass der Hash über die hochgeladene Datei berechnet wird. Falls die Sequenzdaten komprimiert übertragen werden, ist der Hash über das GZIP-Archiv zu bilden.
• Gültiges Format der Sequenzdaten: Für Sequenzdaten werden die Formate FASTA und FASTQ unterstützt.